A aplicação do Sistema APPCC na produção primária de peixes baseia-se na identificação e no controle de perigos de natureza biológica, física e química, relacionados com a saúde do consumidor, durante a produção, estabelecendo os de ponto crítico de controle, com o objetivo de evitá-los, eliminá-los ou reduzi-los a níveis aceitáveis (seguros), garantindo ao produtor a qualificação como fornecedor de produtos gerados na propriedade com qualidade e segurança da matéria-prima.